九十九島の海をテーマにした現代的な水族館。そんな九十九島水族館海きららに泊まりで出かける家族のために、子連れを歓迎しているホテル4軒を近い順に集めました。いちばん近い宿は約0.4km、いちばん遠くても約11.9km（直線距離）。佐世保市の宿です。
添い寝無料は1軒、キッズルームありは1軒、貸切風呂ありは0軒、部屋食・個室食は0軒、温泉かプールがあるのは3軒。いちばん多い設備は「温泉」（3軒）です。
設備は公式サイトの記載をもとにしています（最終確認 2026年10月23日）。料金・空室は予約サイトでご確認ください。
ホテル・佐世保市・九十九島水族館海きららから約0.4km
ホテルフラッグス佐世保九十九島
九十九島パールシーリゾートの目の前。キッズコーナーと平戸の温泉大浴場
1人 ¥9,900〜/泊大人2名1室 1泊 19,775円〜（Google宿泊検索の表示、2026年10月23日泊。食事の有無はプランによる）
- キッズルーム
- ファミリールーム・和室
- 温泉
九十九島パールシーリゾートのすぐ前にあるホテルで、九十九島水族館海きららまで直線で約0.4km。家族向けの本館にはキッズコーナーと、平戸温泉の湯を使った大浴場、ライブキッチンのビュッフェがある。畳のベッドタイプの和室もあり、小さな子連れでも寝かせやすい。
ホテル・佐世保市・九十九島水族館海きららから約2.7km
弓張の丘ホテル
丘の上の温泉ホテル。屋外プールがあり、佐世保駅から無料シャトルバス
1人 ¥6,900〜/泊大人2名1室 1泊 13,860円〜（Google宿泊検索の表示、2026年10月23日泊。食事の有無はプランによる）
- 温泉
- プール
九十九島と佐世保の街を見下ろす丘の上のホテルで、温泉大浴場と屋外プールがある。駐車場は100台分が無料で、佐世保駅との間を無料のシャトルバスが結ぶ。九十九島動植物園森きららまで直線で約3km、九十九島水族館海きららも約3kmで、動物園や水族館と組み合わせやすい。ハウステンボスへも車で行ける距離。
ホテル・佐世保市・九十九島水族館海きららから約3.9km
クインテッサホテル佐世保
小学生までの添い寝が無料。佐世保の街なかで朝食ビュッフェ付き
1人 ¥6,000〜/泊大人2名1室 1泊 11,988円〜（Google宿泊検索の表示、2026年10月23日泊。食事の有無はプランによる）
- 添い寝無料
- ベビーベッド貸出
佐世保駅から車で約5分の街なかのホテルで、動物園や水族館に行く日の宿に向く。ベッド1台につき小学生1名まで無料で添い寝でき、ベビーベッドも1台ある。大浴場はなく、子ども用のスリッパもないので、入浴や身の回りの準備は部屋で済ませる前提で使う。
ホテル・佐世保市・九十九島水族館海きららから約11.9km
ザ パラダイスガーデン サセボ
畳の和室で家族4人。ハウステンボスまで車で10分の温泉ホテル
1人 ¥8,000〜/泊大人2名1室 1泊 16,060円〜（Google宿泊検索の表示、2026年10月23日泊。食事の有無はプランによる）
- ファミリールーム・和室
- 子ども用アメニティ
- 温泉
ハウステンボスから車で約10分の位置にある温泉ホテルで、畳敷きの和室（定員4名）や、和室と洋室が一体になった36㎡の客室がある。子ども用ルームウェアの貸出があり、未就学児の添い寝もできる。ハウステンボスと九十九島の両方を回りたい家族の拠点にしやすい。
